Askeri Savcılık tarafından hazırlanan iddianamede, Yarbay Dönmez’in Ankara Zir Vadisi’ndeki mühimmatın yerini gösteren krokiyi kendisinin çizmediği, silah ve bombaların da kendisine ait olmadığını söylediğine yer verildi. Ancak, İstanbul Kriminal Polis Laboratuvarı ve Jandarma Kriminal Daire Başkanlığı’nın raporları Yarbay Dönmez’i yalanladı. Soruşturma dosyasına giren jandarma raporunda, "Krokinin Yarbay Mustafa Dönmez’in eli ürünü olduğu kanaatine varılmıştır" denildi. İddianamede ele geçirilen el bombalarının MKE tarafından üretildiğine dikkat çekilerek, 20 el bombasının 1981 ve 1984 tarihlerinde Kara Kuvvetleri Komutanlığı’na teslim edildiği belirtildi.
Ancak, Zir Vadisi’nde bulunan 30 el bombası ile Sapanca’da ele geçirilen 22 el bombasından bir bölümünün 1975 yılı öncesi imal edildiği için kafile numaralarına ulaşılamadığı da iddianamedeki yerini aldı.
İddianamede, Yarbay Dönmez hakkında "askeri malzemeyi saklamak" suçundan 12 yıla kadar hapis cezası isteniyor.